En números redondos, el presupuesto global del Instituto ascendió en 1998 a 283 millones de pesos, 18.5 veces más que en 1990. De este presupuesto, el 64% correspondió a ingresos generados con los proyectos realizados por el personal académico, lo cual da una idea de la magnitud de la vinculación del Instituto con la sociedad. El 2.11% de los recursos requeridos del presupuesto para su ejercicio directo en proyectos provino del sector académico (dependencias y programas de la UNAM); el 92.% del sector gubernamental (DDF, secretarías de Estado, organismos descentralizados, institutos estatales y CONACYT) y el 5.89% restante del sector privado y organismos de carácter internacional.